Az epizódképek megtekintéért kattints a képre

Sydney Bristow életének meghatározó döntése volt, amikor elfogadta az SD-6 ügynökség állásajánlatát, mely magát a CIA titkos csoportjaként tűnteti fel. Válójában az SD-6 szervezetét 10 évvel korábban alapította egy csapat CIA ügynök, köztük Arvin Sloane, Sydney főnöke, és Jack Bristow, Sydney apja. Hamar kiderült azonban, hogy az SD-6-nak semmi köze sincs a CIA-hoz, és mivel fegyverkereskedelemmel, ipari, biológiai és szoftverfejlesztések lopásával foglalkoznak, rövid időn belül az Egyesült Államok ellenségévé váltak. Nem az SD-6 az egyetlen ilyen csoport, és ezen szervezetek irányítására hozták létre az SD csoportok vezetői a Tizenkettek klubját.

Sydney számára a legnehezebb feladat, az hogy hazudjon a szeretteinek, sem a szerelme Danny, sem a legjobb barátai Will és Francie nem tudják, hogy titkos ügynök, úgy hiszik egy bankban dolgozik.

Amikor azonban Danny megkéri Syd kezét, megszólal a lelkiismerete, és mindent bevall a fiúnak, pedig tudja az egyetlen szabály az ügynökségnél, az az hogy a szervezet kilétét titokban kell tartani. Arra viszont nem számít, hogy Sloane minderről tudomást szerez és megöleti Dannyt.

Danny halála után Sydney felhagy a munkával, és csak a tanulmányaira koncentrál. Sőt az SD-6-ból is ki akar lépni, de ezzel önmagát is veszélybe sodorja. Amikor bérgyilkosokat küldenek utána, egy olyan ember menti meg, akinek segítségére egyáltalán nem számított, az apja Jack Bristow. Sydney-nek még kiskorában megromlott vele a kapcsolata és most kiderül, hogy ő is az SD-6-nak dolgozik. Sydney rájön, hogy az SD-6 az igazi ellenség, ami ellen küzdeni esküdött, és hogy társai az SD-6-nál továbbra is azt hiszik, hogy a jó oldalon állnak. Sydney megtudja az apjától, hogy Sloane már nem bízik benne, ezért egy magánakció keretében megszerzi számára Milo Rambaldi egyik munkáját.

Ezután Syd elmegy az igazi CIA-hoz, felajánlja nekik a segítségét az SD-6 ellen. A CIA már évek óta próbálja felszámolni a szervezetet sikertelenül. Sydney elvállalja, hogy kettősügynökként belülről próbálja meg tönkretenni az SD-6-ot. Syd összekötője a CIA-s Michael Vaughn lesz, és megtudja, hogy az SD-6-on belül egy másik kettősügynök is dolgozik, aki nem más, mint az apja. Sydney és Jack kapcsolata nem szokványos apa-lánya kapcsolat, ezért meg kell tanulniuk közösen dolgozni és bízni egymásban…