Az epizódképek megtekintéért kattints a képre

Sydney immár kettősügynökként, apja és Vaughn ügynök segítségével próbálja tönkretenni az SD-6-ot. Sydney borzasztóan türelmetlen, úgy gondolja néhány hónap leforgása alatt képes lesz felszámolni az ügynökséget. Folyamatosan szállítja az információkat Vaughnnak, minden olyan személyről, aki üzletel az SD-6-tal és a likvidálásuk meggyengítené azt. Egy ilyen kulcsfontosságú figura Ineni Hasszan.

Vaughn lecsillapítja Sydney lelkesedését és vázolja neki a CIA terveit. Sydneynek vissza kell mennie az SD-6-hoz, és miután megkapja a következő feladatát, felírja egy papírzacskóra, és egy megjelölt kukába dobja, a CIA így szerez tudomást az SD-6 terveiről és elkészítik az ellenakciót. Sydney biztosítja Vaughnt, hogy két hónap elteltével felszámolja az SD-6-ot, azonban Vaughn egy hatalmas ágrajzot mutat neki, amin az SD-6 kapcsolatrendszere látható, és közli a nővel, hogy ez a munka hosszútávra szól, és nem csak az SD-6-ot hanem az egész Szövetséget meg akarják semmisíteni.

Will nem nyugszik, kíváncsi, hogy Sydneynek mire kellett a nővére útlevele, és gyanúsnak tartja Danny halálának körülményeit is, ezért nyomozni szeretne, de Sydney megkéri, hogy ne tegye.

Sydney és Dixon következő feladata az SD-6-nál az lesz, hogy Moszkvában ellopott hidegháborús aktákat szerezzenek vissza és megakadályozzák azok cseréjét. A feladat vázolása után kiderül, hogy Jack is az SD-6-nál dolgozik, és miután Sydney rákérdez Jack bevallja, hogy tudott arról, hogy Sloane meg akarja öletni Dannyt.

Sydney a megbeszélt módon tudatja a CIA-val a feladatát, majd Vaughn felkeresi és elmondja az ellenlépéseket. Sydneynek meg kell szereznie az aktákat és hazafelé jövet a reptéren át kell adja őket Vaughnnak, aki másolatot készít róluk, majd rögtön visszajuttatja Sydneynek.

Will, Sydney tudta nélkül elkezd nyomozni Danny halála után.

Moszkvában kiderül, hogy az akták cseréjéről szó sem volt, akiknek a birtokában vannak a dokumentumok nem akartak üzletet kötni. Sydney megszerzi őket, és a visszatérés után sikeresen megtörténik a lemezek másolása.

Will elmondja Sydneynek, hogy Danny a halála napján Szingapúrba akart repülni. Sydney nincs meglepve és tudatja Willel, hogy ő is utazott volna Danny után. Sydney még egyszer megkéri Willt, hogy hagyjon fel a nyomozással.

A Moszkvában megszerzett aktákból az kiderül, hogy a hidegháború alatt 6 nukleáris töltetet csempésztek be az Államokba, melyeket utána hatástalanítottak, de van még egy atombomba, aminek a hollétéről nem tudnak semmit. Valószínű, hogy Milovics Ivanovnál van a bomba, Sydney feladata, hogy mindent kiderítsen a férfiról. Sydney úgy dönt, hogy egyedül keresi fel Ivanovot. Meg is találja a férfinak a sírját, miután kiásta azt, Sydney megtalálja a bombát, ami ezután rögtön elkezd visszaszámlálni. Sydney Marshallt hívja, hogy segítsen neki deaktiválni a szerkezetet, sikerrel is járnak.

Vaughn felelősségre vonja Sydneyt amiért az SD-6-ot hívta, így ők szerezték meg a bombát, amit rögtön Kairóban szállítottak, hiszen eladták Ineni Hasszannak. Sydney úgy dönt, visszalopja.

Sydney rájön, hogy Jack vette a jegyeket Szingapúrba, segíteni akart Dannynek és neki. Syd megkéri apját, hogy mentse ki az SD-6-nál míg ő Egyiptomban lesz.

Vaughnt leváltják, többé nem ő Sydney kapcsolata a CIA-nál, egy idősebb tisztet jelölnek ki mellé.

Kairóban Sydney bejut Hasszan bázisára, megszerzi a töltetet, azonban ekkor Hasszan pisztolyt szegez a nő fejéhez...