Jack, Sydney helyett Hasszan embereire céloz, majd lányával együtt végrehajtja a CIA tervét. A CIA menedékházában megrendezik Hasszan halálát, Jack képeket készít a ’halott férfiról’, melyeket megmutat majd Sloane-nak, elhitetve vele, hogy az akció sikerrel járt. Jack megkapja az ügyféllistát, Hasszant pedig átszállítják Los Angelesbe, a CIA foglyaként.

Sydney teljesen el van ragadtatva az apja miatt, azonban Vaughn elmondja neki, hogy a CIA megfejtette a Sydney könyveiben szereplő kódokat. A kódok olyan CIA ügynökök fedőneveit jelölik, akiket egytől-egyig meggyilkoltak. Egy KGB ügynök volt a tettes, így Sydney gyanúja, hogy az apja a KGB-nek is dolgozott beigazolódni látszik. Vaughn fel akarja jelenteni Jacket.

Sloane úgy érzi, fellélegezhet, hiszen Hasszan halott, azonban úgy tűnik, hogy egy Minos Sakkoulas nevű férfi átvette Hasszan üzletét, és kapcsolatba lépett annak régi ügyfeleivel. Az SD-6 ’elcsípett’ egy üzenetet, melyben Sakkoulas ’A csomagról’ beszél, és az említett tárgyat Görögországban próbálja eladni. Sydney és Dixon feladata ’A csomag’ megszerzése.

Hasszant a CIA Los Angelesi menedékházába viszik, Vaughn megpróbálja kideríteni mi az ’A csomag’, de Hasszan nem hajlandó segíteni neki. Hasszan azt akarja, hogy a családját szállítsák át az Egyesült Államokba, csak akkor fog segíteni.

Sydney belátja, hogy az apjának bűnhődnie kell, de megkéri Vaughnt, hogy nélküle ne lépjen semmit.

Athénban Sydney és Dixon megszerzi az információkat, azonban Sydneynek ezúttal nem sikerül tudatnia azokat a CIA-val.

Hasszan elmondja Vaughnnak, hogy ’A csomag’ az egyik fegyverraktárában van Krétán.

Kiderül, hogy Vaughn apját is az a KGB ügynök ölte meg, aki a többi CIA ügynököt, emiatt Vaughn úgy dönt, lépni fog és egyedül fogja feljelenteni Jacket.

Sydney úgy intézi, hogy Sloane Jacktől tudja meg, hol van Hasszan raktára, Sloane pedig Sydneyt küldi Krétára ’A csomagért’.

Sydney sikeresen bejut a raktárba, meg is találja a keresett tárgyat, azonban Hasszan olyan kódokat adott meg a CIA-nak, mellyel Sydney az önmegsemmisítőt indítja el. Hasszan csak akkor mondja meg a kódokat, ha írásos biztosítékot kap arról, hogy a tanúvédelmi program keretében megvédik a családját. Hasszan eléri a célját, és miután megadta a helyes kódokat, Sydney épségben kijut.

Miután Vaughn feljelentette Jacket a CIA-nál egy meghallgatás keretében kiderül, hogy nem Jack dolgozott a KGB-nek és likvidálta a CIA ügynököket, hanem Sydney anyja...